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コナン、蘭、小五郎が訪れた「弦藤究美術館」――通称“渦巻館”。その名のとおり渦巻モチーフの不思議な館で、突如殺人事件が発生。複数人が悲鳴と銃声を聞き、すぐに現場へ駆けつけたにもかかわらず、犯人の姿を見た者は誰ひとりいなかった。消えた犯人を追う中、館に隠された秘密部屋を発見するが、第二の事件が巻き起こってしまう。第一の事件について何かを知っていた様子だった第二の被害者……彼はいったい何を見たのか?